دوره شناسایی توالی‌های تنظیم‌کننده ژن: رویکردهای محاسباتی همراه با فلش‌کارت آموزشی — ارائه روی فلش مموری

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره شناسایی توالی‌های تنظیم‌کننده ژن: رویکردهای محاسباتی

موضوع کلی: زیست‌شناسی مولکولی

موضوع میانی: ژنتیک محاسباتی و بیوانفورماتیک

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مقدمه‌ای بر ژنتیک محاسباتی و بیوانفورماتیک
• 2. بانک‌های اطلاعاتی توالی DNA و پروتئین
• 3. جستجوی توالی: الگوریتم‌های پایه
• 4. تراز کردن توالی‌ها: روش‌های جهانی و محلی
• 5. درخت‌های فیلوژنتیک و روش‌های ساخت آن‌ها
• 6. مقدمه‌ای بر تنظیم بیان ژن
• 7. عناصر تنظیم‌کننده ژن: پروموترها و اینهانسورها
• 8. پروتئین‌های دخیل در تنظیم بیان ژن
• 9. شناسایی جایگاه‌های اتصال فاکتورهای رونویسی
• 10. ماتریس وزن توالی (PWM)
• 11. ماتریس موقعیت وزن (PSSM)
• 12. روش‌های آماری در شناسایی جایگاه‌های اتصال
• 13. روش‌های مبتنی بر یادگیری ماشین در شناسایی جایگاه‌های اتصال
• 14. شبکه‌های عصبی مصنوعی در بیوانفورماتیک
• 15. مدل‌های مارکوف پنهان (HMM) در شناسایی جایگاه‌های اتصال
• 16. برنامه‌نویسی پویا و کاربرد آن در بیوانفورماتیک
• 17. تحلیل توالی‌های Promoter
• 18. تحلیل توالی‌های Enhancer
• 19. نقش میکرو RNAها در تنظیم بیان ژن
• 20. شناسایی و تحلیل میکرو RNAها
• 21. تحلیل بیان ژن با استفاده از Microarray
• 22. توالی‌یابی نسل جدید (NGS) و کاربردهای آن در بیوانفورماتیک
• 23. تحلیل داده‌های NGS برای شناسایی جایگاه‌های اتصال
• 24. تحلیل ChIP-seq برای شناسایی جایگاه‌های اتصال
• 25. تحلیل DNase-seq برای شناسایی مناطق باز DNA
• 26. تحلیل داده‌های RNA-seq برای بررسی بیان ژن
• 27. ادغام داده‌های چندگانه برای شناسایی دقیق‌تر جایگاه‌های اتصال
• 28. تحلیل مسیرهای سیگنالینگ و شبکه‌های تنظیم‌کننده ژن
• 29. مقدمه‌ای بر مدل‌سازی سیستم‌های بیولوژیکی
• 30. تحلیل شبکه‌های تنظیم‌کننده ژن با استفاده از گراف
• 31. تحلیل داده‌های ژنومیکس مقایسه‌ای
• 32. شناسایی عناصر تنظیم‌کننده ژن محافظت‌شده در گونه‌های مختلف
• 33. تحلیل واریانت‌های ژنتیکی و تأثیر آن‌ها بر تنظیم بیان ژن
• 34. پلی‌مورفیسم تک نوکلئوتیدی (SNP) و ارتباط آن با بیماری‌ها
• 35. تحلیل GWAS (مطالعات ارتباط گسترده ژنومی)
• 36. بیوانفورماتیک ساختاری و پیش‌بینی ساختار پروتئین
• 37. شناسایی جایگاه‌های اتصال پروتئین به DNA با استفاده از داده‌های ساختاری
• 38. مقدمه‌ای بر سیستم‌های بیولوژیکی مصنوعی
• 39. طراحی و ساخت مدارهای ژنتیکی
• 40. کاربردهای بیوانفورماتیک در پزشکی شخصی
• 41. تحلیل داده‌های ژنومی برای تشخیص و درمان بیماری‌ها
• 42. مقدمه‌ای بر هوش مصنوعی در بیوانفورماتیک
• 43. یادگیری عمیق و کاربردهای آن در شناسایی جایگاه‌های اتصال
• 44. تحلیل تصاویر سلولی با استفاده از بیوانفورماتیک
• 45. تحلیل داده‌های متابولومیکس
• 46. تحلیل داده‌های پروتئومیکس
• 47. تحلیل داده‌های اپی‌ژنتیک
• 48. مقدمه‌ای بر سیستم‌های بیولوژیکی پیچیده
• 49. مدل‌سازی ریاضی سیستم‌های بیولوژیکی
• 50. تحلیل داده‌های متاژنومیکس
• 51. بیوانفورماتیک و کشاورزی
• 52. بیوانفورماتیک و محیط زیست
• 53. ابزارهای رایج بیوانفورماتیکی
• 54. پایگاه‌های داده ژنومی و پروتئومی
• 55. زبان‌های برنامه‌نویسی در بیوانفورماتیک (Python, R)
• 56. آمار در بیوانفورماتیک
• 57. تصویرسازی داده‌های بیوانفورماتیکی
• 58. چالش‌ها و آینده بیوانفورماتیک
• 59. اخلاق در بیوانفورماتیک و حریم خصوصی داده‌ها