دوره تحلیل دادههای ChIP-seq برای بررسی برهمکنشهای پروتئین-DNA در مطالعات سرطان با استفاده از ابزارهای Bioconductor همراه با فلشکارت آموزشی — ارائه روی فلش مموری
🎓 دوره آموزشی جامع
📚 اطلاعات دوره
عنوان دوره: دوره تحلیل دادههای ChIP-seq برای بررسی برهمکنشهای پروتئین-DNA در مطالعات سرطان با استفاده از ابزارهای Bioconductor
موضوع کلی: زیستشناسی محاسباتی و بیوانفورماتیک
موضوع میانی: تحلیل دادههای توالییابی نسل جدید (NGS)
📋 سرفصلهای دوره
- 1. مبانی زیستشناسی مولکولی و برهمکنشهای پروتئین و DNA
- 2. مقدمهای بر فناوری توالییابی نسل جدید و کاربرد آن در ChIP-seq
- 3. آشنایی با محیط نرمافزاری R و بسته Bioconductor برای تحلیل دادههای زیستی
- 4. ساختار فایلهای دادههای خام توالییابی و فرمت FASTQ
- 5. کنترل کیفیت دادههای خام با استفاده از ابزار FastQC
- 6. پیشپردازش و پیرایش توالیها با استفاده از ابزارهای تخصصی
- 7. آشنایی با ژنوم مرجع و فرمتهای فایلی FASTA و GTF
- 8. تراز کردن توالیها به ژنوم مرجع با استفاده از ابزار Bowtie2
- 9. کار با فایلهای خروجی تراز شده در قالب فرمت SAM و BAM
- 10. فیلتر کردن و مرتبسازی دادههای تراز شده با ابزارهای SAMtools
- 11. تجسم و بررسی اولیه دادههای تراز شده در مرورگر ژنوم IGV
- 12. مبانی آماری و الگوریتمهای شناسایی قلهها در دادههای ChIP-seq
- 13. شناسایی نواحی غنیسازی شده با استفاده از ابزار MACS2
- 14. استفاده از بستههای Bioconductor برای تحلیل اختصاصی دادههای ChIP-seq
- 15. مدیریت و دستکاری دادههای GenomicRanges در محیط R
- 16. نرمالسازی دادهها و حذف اثرات پسزمینه در تحلیلهای کمی
- 17. تحلیل برهمکنشهای پروتئین-DNA در نمونههای سرطانی
- 18. شناسایی نواحی اتصال فاکتورهای رونویسی در ژنوم انسان
- 19. حاشیه نویسی قلههای شناسایی شده نسبت به ژنهای هدف
- 20. آنالیز توزیع ژنومی نواحی اتصال با استفاده از بستههای ChipSeeker
- 21. بررسی الگوهای اتصال در نواحی پروموتری و اینترونی
- 22. تحلیل غنیسازی موتیفهای DNA در نواحی شناسایی شده
- 23. کشف الگوهای تنظیمی با استفاده از ابزارهای تحلیل موتیف
- 24. تلفیق دادههای ChIP-seq با دادههای بیان ژن برای درک مکانیسمهای سرطان
- 25. تجسم بصری نتایج تحلیل با استفاده از نمودارهای پروفایل و Heatmap
- 26. ارزیابی تکرارپذیری آزمایشها با استفاده از تحلیل همبستگی
- 27. تفسیر بیولوژیکی نتایج در بافتهای سرطانی و سلولهای سالم
- 28. گزارشنویسی و مستندسازی تحلیلهای بیوانفورماتیکی
- 29. چالشهای محاسباتی در تحلیل دادههای NGS
- 30. اخلاق در پژوهشهای زیستپزشکی و حفظ حریم خصوصی دادههای ژنتیکی بیماران
محتویات بسته آموزشی
🌐 سامانه آنلاین فلشکارت؛ مرور هدفمند و هوشمند
اکانت ارائهشده، دسترسی به نسخه تحت وب سامانه فلشکارت ویژه این دوره را فراهم میکند. این سامانه از الگوریتم زمانبندی مرور SM-2 استفاده میکند و بر اساس ارزیابی شما از میزان یادآوری هر کارت، زمان مرورهای بعدی را تنظیم میکند.
به این ترتیب، کارتهای دشوارتر میتوانند زودتر مرور شوند و برای تثبیت مطالب در حافظه، برنامه مرور متناسبتری داشته باشید.
مدتزمان معادل آموزشی بر اساس برآورد این دوره در گواهی درج میشود.
گواهی دوزبانه با استعلام آنلاین
پس از تکمیل فعالیتهای لازم و تأیید درخواست، گواهی پایان دوره به زبان فارسی و انگلیسی صادر میشود. گواهی دارای لینک اختصاصی و QR Code برای بررسی و استعلام آنلاین است.
این گواهی صرفاً بهعنوان گواهی اتمام دوره آموزشی صادر میشود و معادل مدرک دانشگاهی، آکادمیک یا مدرک رسمی مورد تأیید نهادهای دولتی نیست. صدور آن منوط به تکمیل شرایط دوره و تأیید نهایی درخواست است.
نظرات
هنوز نظری ثبت نشده است.
وارد شوید تا نظر ثبت کنید.