دوره اصول و کاربردهای توالی‌یابی کل ژنوم باکتری‌ها در تشخیص‌های آزمایشگاهی و کنترل سلامت عمومی همراه با فلش‌کارت آموزشی — ارائه روی فلش مموری

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره اصول و کاربردهای توالی‌یابی کل ژنوم باکتری‌ها در تشخیص‌های آزمایشگاهی و کنترل سلامت عمومی

موضوع کلی: زیست‌فناوری و علوم میکروبی

موضوع میانی: ژنومیک و بیوانفورماتیک باکتریایی

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مبانی و تاریخچه توالی‌یابی نسل جدید در میکروب‌شناسی
• 2. آشنایی با ساختار ژنوم باکتری‌ها و عناصر ژنتیکی متحرک
• 3. تجهیزات و پلتفرم‌های رایج توالی‌یابی کل ژنوم در آزمایشگاه
• 4. آماده‌سازی نمونه‌های بالینی و استخراج DNA باکتریایی با کیفیت بالا
• 5. روش‌های تهیه کتابخانه برای توالی‌یابی ژنوم باکتری
• 6. کنترل کیفیت داده‌های خام توالی‌یابی و فرمت‌های استاندارد
• 7. مراحل پیش‌پردازش و حذف توالی‌های آلوده و کم‌کیفیت
• 8. اصول اسمبل کردن ژنوم‌های باکتریایی به روش De novo
• 9. استفاده از روش‌های مرجع‌محور برای بازسازی توالی ژنوم
• 10. ارزیابی کیفیت و پیوستگی ژنوم‌های اسمبل شده
• 11. حاشیه‌نویسی ژنومی و شناسایی ژن‌های کدکننده پروتئین
• 12. تحلیل بیوانفورماتیکی ژن‌های مقاومت آنتی‌بیوتیکی
• 13. شناسایی فاکتورهای بیماری‌زایی و توکسین‌ها در ژنوم باکتری‌ها
• 14. تعیین تایپ‌های توالی چندجایگاهی در سطح ژنوم
• 15. مقایسه ژنوم‌های باکتریایی برای مطالعات اپیدمیولوژیک
• 16. کاربرد توالی‌یابی در ردیابی منشأ طغیان‌های عفونی
• 17. تحلیل ژنوم هسته و ژنوم جانبی در گونه‌های باکتریایی
• 18. کاربرد بیوانفورماتیک در شناسایی سویه‌های باکتریایی جدید
• 19. اصول طراحی پرایمرها بر اساس داده‌های ژنومی
• 20. کاربرد توالی‌یابی در تشخیص سریع عفونت‌های بیمارستانی
• 21. پایش ژنومی مقاومت‌های میکروبی در سطح سلامت جامعه
• 22. مطالعه تکامل و تغییرات ژنتیکی باکتری‌ها در طول زمان
• 23. تجسم داده‌های ژنومی و ترسیم درخت‌های فیلوژنتیک
• 24. مدیریت و ذخیره‌سازی داده‌های توالی‌یابی در بانک‌های اطلاعاتی
• 25. استانداردهای گزارش‌دهی نتایج توالی‌یابی در تشخیص بالینی
• 26. اخلاق حرفه‌ای و امنیت داده‌های ژنومی در آزمایشگاه‌های تشخیص پزشکی
• 27. کاربرد توالی‌یابی در کنترل کیفی فرآورده‌های دارویی و واکسن‌ها
• 28. آینده توالی‌یابی کل ژنوم در مدیریت سلامت عمومی کشور
• 29. چالش‌های فنی و اقتصادی پیاده‌سازی توالی‌یابی در آزمایشگاه‌های تشخیص طبی
• 30. پروژه‌های عملی و تحلیل داده‌های توالی‌یابی در محیط‌های تحقیقاتی