اپلیکیشن اندرویدی فلش‌کارت آموزشی تحلیل داده، گزارش‌دهی پیشرفته و مصورسازی نتایج در پلتفرم BD Rhapsody

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره تحلیل داده، گزارش‌دهی پیشرفته و مصورسازی نتایج در پلتفرم BD Rhapsody

موضوع کلی: بیوانفورماتیک و تحلیل داده‌های زیستی

موضوع میانی: آنالیز و گزارش‌دهی داده‌های تک‌سلولی با پلتفرم BD Rhapsody

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مقدمه‌ای بر توالی‌یابی تک‌سلولی (Single-Cell RNA-seq) و پلتفرم BD Rhapsody
• 2. آشنایی با ساختار فایل‌های خروجی و خط لوله پردازشی (Analysis Pipeline) در BD Rhapsody
• 3. نصب و راه‌اندازی ابزارهای تحلیلی و محیط‌های نرم‌افزاری وابسته به سیستم
• 4. درک معیارهای کیفیت داده‌های توالی‌یابی و بررسی کیفیت نمونه‌ها (Quality Control)
• 5. تحلیل فایل‌های متریکس بیان ژن و پیش‌پردازش ماتریس شمارش
• 6. فیلتر کردن سلول‌ها و ژن‌های کم‌کیفیت بر اساس معیارهای آماری
• 7. نرمال‌سازی داده‌های بیان ژن تک‌سلولی برای حذف اثرات تکنیکال
• 8. شناخت ژن‌های شاخص (Variable Genes) و کاهش ابعاد داده با روش PCA
• 9. پیاده‌سازی الگوریتم‌های خوشه‌بندی سلولی (Clustering) بر اساس پروفایل بیان
• 10. مصورسازی خوشه‌های سلولی با نمودارهای کاهش بعد (t-SNE و UMAP)
• 11. شناسایی مارکرهای اختصاصی هر خوشه سلولی و تعیین هویت سلول‌ها
• 12. تحلیل بیان افتراقی ژن‌ها (Differential Gene Expression) بین جمعیت‌های مختلف سلولی
• 13. بررسی بیان آنتی‌بادی‌های چندگانه و پروتئین‌های سطحی در تحلیل‌های ترکیبی
• 14. آنالیز نمونه‌های چندگانه و روش‌های ادغام داده‌ها (Data Integration & Batch Effect Correction)
• 15. تفسیر گزارش‌های تحلیلی استاندارد تولیدشده توسط نرم‌افزار BD Rhapsody Analysis
• 16. سفارشی‌سازی پارامترها و تنظیم گزارش‌های خروجی متناسب با اهداف پژوهشی
• 17. مصورسازی پیشرفته داده‌های تک‌سلولی با نمودارهای حرارتی (Heatmaps) و ویولن‌پلات‌ها
• 18. استخراج داده‌ها برای تحلیل‌های تکمیلی در محیط‌های R و Python (Seurat و Scanpy)
• 19. مستندسازی و تهیه گزارش‌های مدیریتی و علمی از نتایج آنالیز تک‌سلولی
• 20. عیب‌یابی خطاهای رایج در پردازش داده‌ها و رفع مشکلات کیفیت خروجی
• 21. پروژه جامع: تحلیل کامل یک مجموعه داده واقعی از پلتفرم BD Rhapsody تا تهیه گزارش نهایی