اپلیکیشن اندرویدی فلش‌کارت آموزشی راهنمای کاربردی آماده‌سازی کتابخانه برای توالی‌یابی نانوپور (Nanopore) در جدایه‌های میکروبی

🎓 دوره آموزشی جامع

📚 اطلاعات دوره

عنوان دوره: دوره راهنمای کاربردی آماده‌سازی کتابخانه برای توالی‌یابی نانوپور (Nanopore) در جدایه‌های میکروبی

موضوع کلی: زیست‌فناوری و فناوری‌های نوین آزمایشگاهی

موضوع میانی: روش‌های پیشرفته تعیین توالی ژنوم میکروبی

📋 سرفصل‌های دوره

• 1. مبانی توالی‌یابی نسل جدید و فناوری نانوپور
• 2. معرفی پلتفرم‌های توالی‌یابی نانوپور در آزمایشگاه‌های میکروبیولوژی
• 3. اصول استخراج DNA ژنومی با کیفیت بالا از جدایه‌های میکروبی
• 4. روش‌های ارزیابی کمی و کیفی DNA استخراج‌شده پیش از آماده‌سازی کتابخانه
• 5. آشنایی با کیت‌های آماده‌سازی کتابخانه (Library Prep) برای نانوپور
• 6. اصول کار با نانوذرات و روش‌های خالص‌سازی DNA
• 7. آماده‌سازی نمونه‌های میکروبی برای توالی‌یابی ژنوم کامل
• 8. روش‌های برش آنزیمی و شکست مکانیکی DNA برای طول قطعات بهینه
• 9. کاربرد آنزیم‌های ترمیم‌کننده در آماده‌سازی کتابخانه
• 10. اتصال آداپتورها به قطعات DNA در فناوری نانوپور
• 11. روش‌های خالص‌سازی کتابخانه با استفاده از مهره‌های مغناطیسی (AMPure XP)
• 12. اصول و استانداردهای کمی‌سازی کتابخانه نهایی پیش از بارگذاری
• 13. بهینه‌سازی غلظت DNA برای افزایش بازده توالی‌یابی
• 14. مبانی تئوری بارگذاری نمونه بر روی فلوسل (Flow Cell)
• 15. بررسی سلامت و کیفیت فلوسل پیش از آغاز عملیات توالی‌یابی
• 16. آماده‌سازی بافرها و محلول‌های مورد نیاز در پروتکل توالی‌یابی
• 17. مدیریت نمونه‌های چندگانه با استفاده از تکنیک بارکدگذاری (Barcoding)
• 18. روش‌های ادغام (Pooling) نمونه‌ها برای توالی‌یابی همزمان
• 19. عیب‌یابی خطاهای رایج در مرحله آماده‌سازی کتابخانه
• 20. ملاحظات ایمنی و بهداشت محیط آزمایشگاه در کار با عوامل میکروبی
• 21. ضدعفونی‌سازی و مدیریت پسماندهای آزمایشگاهی مطابق پروتکل‌های ملی
• 22. آشنایی با نرم‌افزارهای کنترل کیفیت اولیه داده‌های خام (Raw Data)
• 23. مبانی بیوانفورماتیکی برای پردازش داده‌های توالی‌یابی نانوپور
• 24. نحوه خوانش و تفسیر گزارش‌های کیفیت توالی‌یابی در محیط نرم‌افزاری
• 25. مستندسازی نتایج آزمایشگاهی و حفظ داده‌ها در پایگاه‌های داده داخلی
• 26. استانداردهای گزارش‌دهی نتایج توالی‌یابی در مراکز تحقیقاتی کشور
• 27. کاربردهای توالی‌یابی نانوپور در شناسایی سریع عوامل بیماری‌زای میکروبی
• 28. بررسی مقاومت‌های آنتی‌بیوتیکی از طریق داده‌های توالی‌یابی ژنوم
• 29. نقش توالی‌یابی نانوپور در مطالعات اپیدمیولوژی مولکولی
• 30. اصول اخلاق حرفه‌ای در پژوهش‌های ژنتیکی و زیست‌فناوری
• 31. آشنایی با قوانین و مقررات ایمنی زیستی در آزمایشگاه‌های ژنتیک
• 32. روش‌های نگهداری طولانی‌مدت کتابخانه‌های آماده‌سازی شده
• 33. بهینه‌سازی پروتکل‌ها برای جدایه‌های میکروبی با محتوای GC متفاوت
• 34. چالش‌های توالی‌یابی در نمونه‌های با خلوص پایین
• 35. تکنیک‌های افزایش طول خوانش (Read Length) در نانوپور
• 36. استفاده از کنترل‌های مثبت و منفی در فرآیند آماده‌سازی کتابخانه
• 37. اصول گزارش‌نویسی علمی از داده‌های توالی‌یابی
• 38. آشنایی با زیرساخت‌های محاسباتی مورد نیاز برای آنالیز داده‌های نانوپور
• 39. آینده فناوری نانوپور در تشخیص‌های بالینی و پژوهش‌های پایه
• 40. مرور نهایی بر استانداردهای آزمایشگاهی توالی‌یابی نانوپور