ترجمه فارسی مقاله ProteinBench: یک ارزیابی کل نگر از مدل های پایه پروتئین

انتخاب پلن

انتخاب پلن برای ادامه خرید الزامی است.

پرداخت اقساطی
در صورت خرید اقساطی هر قسط: 37,500 تومان
۴ قسط ماهانه. بدون سود، چک و ضامن.
پرداخت اقساطی با دیجی‌پی پرداخت اقساطی با ترب‌پی
عنوان مقاله به انگلیسی ProteinBench: A Holistic Evaluation of Protein Foundation Models
عنوان مقاله به فارسی ProteinBench: یک ارزیابی کل نگر از مدل های پایه پروتئین
نویسندگان Fei Ye, Zaixiang Zheng, Dongyu Xue, Yuning Shen, Lihao Wang, Yiming Ma, Yan Wang, Xinyou Wang, Xiangxin Zhou, Quanquan Gu
فرمت مقاله انگلیسی PDF
تعداد صفحات 29
لینک دانلود رایگان مقاله انگلیسی دانلود مقاله
دسته بندی موضوعات Quantitative Methods,Artificial Intelligence,Machine Learning,Biomolecules,روشهای کمی , هوش مصنوعی , یادگیری ماشین , مولکولهای زیستی ,
توضیحات Submitted 10 September, 2024; originally announced September 2024. , Comments: 29 pages, 1 figure and 11 tables
توضیحات به فارسی ارسال شده 10 سپتامبر 2024 ؛در ابتدا سپتامبر 2024 اعلام شد ، نظرات: 29 صفحه ، 1 شکل و 11 میز
اطلاعات بیشتر از این مقاله در پایگاه های علمی INSPIRE HEP
NASA ADS
Google Scholar
Semantic Scholar

📚 محتوای این محصول آموزشی (پکیج کامل)

علاوه بر مقاله اصلی انگلیسی که دریافت می کنید، برای یادگیری عمیق‌تر و تسلط کامل بر مباحث مجموعه‌ای از کتاب‌های آموزشی نیز ارائه می‌شود.

🎯 این بسته یک دورهٔ آموزشی کامل و چندلایه است؛ شامل ویدیوهای آموزشی، کتاب‌ها، تمرین‌ها و خودآزمایی.

ℹ️ نکات مهم هنگام خرید

  • این محصول به صورت فایل دانلودی کامل ارائه می‌شود.
  • توجه: لینک‌های اختصاصی دوره طی حداکثر 24 ساعت پس از ثبت سفارش ارسال می‌شوند.
  • دقت کنید لینک ها به شماره موبایل شما ارسال می شوند. پس در ارائه شماره موبایل صحیح دقت کنید.
  • برای راهنمایی در مورد نحوه دانلود به شماره 09395106248 پیامک دهید یا تماس بگیرید. (ایده آل ترین گزینه ارسال پیام در یکی از پیام رسان ها به همین شماره است تا سریعا لینک های محصول همان جا برای شما ارسال گردد.)
  • اگر پرداخت انجام شده ولی بعد از 24 ساعت هنوز لینک‌ها را دریافت نکرده‌اید، نام و نام خانوادگی و نام محصول را پیامک کنید تا لینک‌ها دوباره ارسال شوند.

💬 راه‌های ارتباطی پشتیبانی:
واتس‌اپ یا هر پیام رسان داخلی یا پیامک: 09395106248
تلگرام: @ma_limbs

چکیده

Recent years have witnessed a surge in the development of protein foundation models, significantly improving performance in protein prediction and generative tasks ranging from 3D structure prediction and protein design to conformational dynamics. However, the capabilities and limitations associated with these models remain poorly understood due to the absence of a unified evaluation framework. To fill this gap, we introduce ProteinBench, a holistic evaluation framework designed to enhance the transparency of protein foundation models. Our approach consists of three key components: (i) A taxonomic classification of tasks that broadly encompass the main challenges in the protein domain, based on the relationships between different protein modalities; (ii) A multi-metric evaluation approach that assesses performance across four key dimensions: quality, novelty, diversity, and robustness; and (iii) In-depth analyses from various user objectives, providing a holistic view of model performance. Our comprehensive evaluation of protein foundation models reveals several key findings that shed light on their current capabilities and limitations. To promote transparency and facilitate further research, we release the evaluation dataset, code, and a public leaderboard publicly for further analysis and a general modular toolkit. We intend for ProteinBench to be a living benchmark for establishing a standardized, in-depth evaluation framework for protein foundation models, driving their development and application while fostering collaboration within the field.

چکیده به فارسی (ترجمه ماشینی)

سالهای اخیر شاهد افزایش در توسعه مدلهای بنیاد پروتئین بوده ایم ، به طور قابل توجهی عملکرد در پیش بینی پروتئین و کارهای تولیدی اعم از پیش بینی ساختار سه بعدی و طراحی پروتئین گرفته تا دینامیک ساختاری.با این حال ، توانایی ها و محدودیت های مرتبط با این مدل ها به دلیل عدم وجود یک چارچوب ارزیابی یکپارچه ، ضعیف درک نشده است.برای پر کردن این شکاف ، ما Proteinbench را معرفی می کنیم ، یک چارچوب ارزیابی جامع که برای تقویت شفافیت مدلهای بنیاد پروتئین طراحی شده است.رویکرد ما شامل سه مؤلفه اصلی است: (i) طبقه بندی طبقه بندی از وظایف که به طور گسترده شامل چالش های اصلی در حوزه پروتئین ، بر اساس روابط بین روشهای مختلف پروتئین است.(ب) یک رویکرد ارزیابی چند متری که عملکرد را در چهار بعد کلیدی ارزیابی می کند: کیفیت ، تازگی ، تنوع و استحکام.و (iii) تجزیه و تحلیل های عمیق از اهداف مختلف کاربر ، ارائه یک نمای جامع از عملکرد مدل.ارزیابی جامع ما از مدلهای بنیاد پروتئین چندین یافته کلیدی را نشان می دهد که توانایی ها و محدودیت های فعلی آنها را روشن می کند.برای ارتقاء شفافیت و تسهیل تحقیقات بیشتر ، ما مجموعه داده های ارزیابی ، کد و یک رهبر عمومی را به صورت عمومی برای تجزیه و تحلیل بیشتر و یک ابزار کلی مدولار منتشر می کنیم.ما قصد داریم Proteinbench یک معیار زندگی برای ایجاد یک چارچوب ارزیابی استاندارد و عمیق برای مدل های بنیاد پروتئین ، هدایت توسعه و کاربرد آنها ضمن تقویت همکاری در این زمینه باشد.

📚 محتوای این محصول آموزشی (پکیج کامل)

علاوه بر مقاله اصلی انگلیسی که دریافت می کنید، برای یادگیری عمیق‌تر و تسلط کامل بر مباحث مجموعه‌ای از کتاب‌های آموزشی نیز ارائه می‌شود.

🎯 این بسته یک دورهٔ آموزشی کامل و چندلایه است؛ شامل ویدیوهای آموزشی، کتاب‌ها، تمرین‌ها و خودآزمایی.

ℹ️ نکات مهم هنگام خرید

  • این محصول به صورت فایل دانلودی کامل ارائه می‌شود.
  • توجه: لینک‌های اختصاصی دوره طی حداکثر 24 ساعت پس از ثبت سفارش ارسال می‌شوند.
  • دقت کنید لینک ها به شماره موبایل شما ارسال می شوند. پس در ارائه شماره موبایل صحیح دقت کنید.
  • برای راهنمایی در مورد نحوه دانلود به شماره 09395106248 پیامک دهید یا تماس بگیرید. (ایده آل ترین گزینه ارسال پیام در یکی از پیام رسان ها به همین شماره است تا سریعا لینک های محصول همان جا برای شما ارسال گردد.)
  • اگر پرداخت انجام شده ولی بعد از 24 ساعت هنوز لینک‌ها را دریافت نکرده‌اید، نام و نام خانوادگی و نام محصول را پیامک کنید تا لینک‌ها دوباره ارسال شوند.

💬 راه‌های ارتباطی پشتیبانی:
واتس‌اپ یا هر پیام رسان داخلی یا پیامک: 09395106248
تلگرام: @ma_limbs

نظرات

هنوز نظری ثبت نشده است.

وارد شوید تا نظر ثبت کنید.