ترجمه فارسی مقاله PHAGO: حاشیه نویسی عملکرد پروتئین برای باکتریوفاژها با ادغام زمینه ژنومی

انتخاب پلن

انتخاب پلن برای ادامه خرید الزامی است.

عنوان مقاله به انگلیسی PhaGO: Protein function annotation for bacteriophages by integrating the genomic context
عنوان مقاله به فارسی PHAGO: حاشیه نویسی عملکرد پروتئین برای باکتریوفاژها با ادغام زمینه ژنومی
نویسندگان Jiaojiao Guan, Yongxin Ji, Cheng Peng, Wei Zou, Xubo Tang, Jiayu Shang, Yanni Sun
فرمت مقاله انگلیسی PDF
تعداد صفحات 17
لینک دانلود رایگان مقاله انگلیسی دانلود مقاله
دسته بندی موضوعات Quantitative Methods,Artificial Intelligence,Machine Learning,روشهای کمی , هوش مصنوعی , یادگیری ماشین ,
توضیحات Submitted 17 August, 2024; v1 submitted 12 August, 2024; originally announced August 2024. , Comments: 17 pages,6 figures
توضیحات به فارسی ارسال شده 17 اوت 2024 ؛V1 ارسال شده 12 اوت 2024 ؛در ابتدا اوت 2024 اعلام شد ، نظرات: 17 صفحه ، 6 شکل
اطلاعات بیشتر از این مقاله در پایگاه های علمی INSPIRE HEP
NASA ADS
Google Scholar
Semantic Scholar

📚 محتوای این محصول آموزشی (پکیج کامل)

علاوه بر مقاله اصلی انگلیسی که دریافت می کنید، برای یادگیری عمیق‌تر و تسلط کامل بر مباحث مجموعه‌ای از کتاب‌های آموزشی نیز ارائه می‌شود.

🎯 این بسته یک دورهٔ آموزشی کامل و چندلایه است؛ شامل ویدیوهای آموزشی، کتاب‌ها، تمرین‌ها و خودآزمایی.

ℹ️ نکات مهم هنگام خرید

  • این محصول به صورت فایل دانلودی کامل ارائه می‌شود.
  • توجه: لینک‌های اختصاصی دوره طی حداکثر 24 ساعت پس از ثبت سفارش ارسال می‌شوند.
  • دقت کنید لینک ها به شماره موبایل شما ارسال می شوند. پس در ارائه شماره موبایل صحیح دقت کنید.
  • برای راهنمایی در مورد نحوه دانلود به شماره 09395106248 پیامک دهید یا تماس بگیرید. (ایده آل ترین گزینه ارسال پیام در یکی از پیام رسان ها به همین شماره است تا سریعا لینک های محصول همان جا برای شما ارسال گردد.)
  • اگر پرداخت انجام شده ولی بعد از 24 ساعت هنوز لینک‌ها را دریافت نکرده‌اید، نام و نام خانوادگی و نام محصول را پیامک کنید تا لینک‌ها دوباره ارسال شوند.

💬 راه‌های ارتباطی پشتیبانی:
واتس‌اپ یا هر پیام رسان داخلی یا پیامک: 09395106248
تلگرام: @ma_limbs

چکیده

Bacteriophages are viruses that target bacteria, playing a crucial role in microbial ecology. Phage proteins are important in understanding phage biology, such as virus infection, replication, and evolution. Although a large number of new phages have been identified via metagenomic sequencing, many of them have limited protein function annotation. Accurate function annotation of phage proteins presents several challenges, including their inherent diversity and the scarcity of annotated ones. Existing tools have yet to fully leverage the unique properties of phages in annotating protein functions. In this work, we propose a new protein function annotation tool for phages by leveraging the modular genomic structure of phage genomes. By employing embeddings from the latest protein foundation models and Transformer to capture contextual information between proteins in phage genomes, PhaGO surpasses state-of-the-art methods in annotating diverged proteins and proteins with uncommon functions by 6.78% and 13.05% improvement, respectively. PhaGO can annotate proteins lacking homology search results, which is critical for characterizing the rapidly accumulating phage genomes. We demonstrate the utility of PhaGO by identifying 688 potential holins in phages, which exhibit high structural conservation with known holins. The results show the potential of PhaGO to extend our understanding of newly discovered phages.

چکیده به فارسی (ترجمه ماشینی)

باکتریوفاژها ویروس هایی هستند که باکتری ها را هدف قرار می دهند و نقش مهمی در بوم شناسی میکروبی دارند.پروتئین های فاژ در درک زیست شناسی فاژ مانند عفونت ویروس ، تکثیر و تکامل مهم هستند.اگرچه تعداد زیادی از فاژهای جدید از طریق توالی متاگنومیک مشخص شده اند ، اما بسیاری از آنها حاشیه نویسی عملکرد پروتئین محدود دارند.حاشیه نویسی عملکرد دقیق پروتئین های فاژ چالش های مختلفی از جمله تنوع ذاتی آنها و کمبود آن ها را ارائه می دهد.ابزارهای موجود هنوز به طور کامل از خواص منحصر به فرد فاژها در حاشیه نویسی توابع پروتئین استفاده نمی کنند.در این کار ، ما با استفاده از ساختار ژنومی مدولار ژنوم فاژ ، یک ابزار حاشیه نویسی عملکرد پروتئین جدید برای فاژها پیشنهاد می کنیم.Phago با استفاده از تعبیه از جدیدترین مدلهای بنیاد پروتئین و ترانسفورماتور برای گرفتن اطلاعات متنی بین پروتئین ها در ژنوم فاژ ، به ترتیب از روشهای پیشرفته در حاشیه نویسی پروتئین ها و پروتئین ها با عملکردهای غیر معمول به ترتیب 6.78 ٪ و 13.05 ٪ بهبود می یابد.PHAGO می تواند پروتئین های فاقد نتایج جستجوی همسانی را حاشیه نویسی کند ، که برای توصیف ژنوم فاژ به سرعت جمع می شود.ما با شناسایی 688 هولین بالقوه در فاژها ، که دارای حفاظت ساختاری بالایی با هولین های شناخته شده هستند ، کاربرد PHAGO را نشان می دهیم.نتایج نشان می دهد پتانسیل PHAGO برای گسترش درک ما از فاژهای تازه کشف شده.

📚 محتوای این محصول آموزشی (پکیج کامل)

علاوه بر مقاله اصلی انگلیسی که دریافت می کنید، برای یادگیری عمیق‌تر و تسلط کامل بر مباحث مجموعه‌ای از کتاب‌های آموزشی نیز ارائه می‌شود.

🎯 این بسته یک دورهٔ آموزشی کامل و چندلایه است؛ شامل ویدیوهای آموزشی، کتاب‌ها، تمرین‌ها و خودآزمایی.

ℹ️ نکات مهم هنگام خرید

  • این محصول به صورت فایل دانلودی کامل ارائه می‌شود.
  • توجه: لینک‌های اختصاصی دوره طی حداکثر 24 ساعت پس از ثبت سفارش ارسال می‌شوند.
  • دقت کنید لینک ها به شماره موبایل شما ارسال می شوند. پس در ارائه شماره موبایل صحیح دقت کنید.
  • برای راهنمایی در مورد نحوه دانلود به شماره 09395106248 پیامک دهید یا تماس بگیرید. (ایده آل ترین گزینه ارسال پیام در یکی از پیام رسان ها به همین شماره است تا سریعا لینک های محصول همان جا برای شما ارسال گردد.)
  • اگر پرداخت انجام شده ولی بعد از 24 ساعت هنوز لینک‌ها را دریافت نکرده‌اید، نام و نام خانوادگی و نام محصول را پیامک کنید تا لینک‌ها دوباره ارسال شوند.

💬 راه‌های ارتباطی پشتیبانی:
واتس‌اپ یا هر پیام رسان داخلی یا پیامک: 09395106248
تلگرام: @ma_limbs

نظرات

هنوز نظری ثبت نشده است.

وارد شوید تا نظر ثبت کنید.