ترجمه فارسی مقاله mRNA2VEC: mRNA تعبیه شده با مدل زبان در 5'UTR-CDS برای طراحی mRNA

انتخاب پلن

انتخاب پلن برای ادامه خرید الزامی است.

عنوان مقاله به انگلیسی mRNA2vec: mRNA Embedding with Language Model in the 5'UTR-CDS for mRNA Design
عنوان مقاله به فارسی mRNA2VEC: mRNA تعبیه شده با مدل زبان در 5\'UTR-CDS برای طراحی mRNA
نویسندگان Honggen Zhang, Xiangrui Gao, June Zhang, Lipeng Lai
فرمت مقاله انگلیسی PDF
تعداد صفحات 9
لینک دانلود رایگان مقاله انگلیسی دانلود مقاله
دسته بندی موضوعات Quantitative Methods,Artificial Intelligence,Machine Learning,روشهای کمی , هوش مصنوعی , یادگیری ماشین ,
توضیحات Submitted 16 August, 2024; originally announced August 2024.
توضیحات به فارسی ارائه شده 16 اوت 2024 ؛در ابتدا اوت 2024 اعلام شد.
اطلاعات بیشتر از این مقاله در پایگاه های علمی INSPIRE HEP
NASA ADS
Google Scholar
Semantic Scholar

📚 محتوای این محصول آموزشی (پکیج کامل)

علاوه بر مقاله اصلی انگلیسی که دریافت می کنید، برای یادگیری عمیق‌تر و تسلط کامل بر مباحث مجموعه‌ای از کتاب‌های آموزشی نیز ارائه می‌شود.

🎯 این بسته یک دورهٔ آموزشی کامل و چندلایه است؛ شامل ویدیوهای آموزشی، کتاب‌ها، تمرین‌ها و خودآزمایی.

ℹ️ نکات مهم هنگام خرید

  • این محصول به صورت فایل دانلودی کامل ارائه می‌شود.
  • توجه: لینک‌های اختصاصی دوره طی حداکثر 24 ساعت پس از ثبت سفارش ارسال می‌شوند.
  • دقت کنید لینک ها به شماره موبایل شما ارسال می شوند. پس در ارائه شماره موبایل صحیح دقت کنید.
  • برای راهنمایی در مورد نحوه دانلود به شماره 09395106248 پیامک دهید یا تماس بگیرید. (ایده آل ترین گزینه ارسال پیام در یکی از پیام رسان ها به همین شماره است تا سریعا لینک های محصول همان جا برای شما ارسال گردد.)
  • اگر پرداخت انجام شده ولی بعد از 24 ساعت هنوز لینک‌ها را دریافت نکرده‌اید، نام و نام خانوادگی و نام محصول را پیامک کنید تا لینک‌ها دوباره ارسال شوند.

💬 راه‌های ارتباطی پشتیبانی:
واتس‌اپ یا هر پیام رسان داخلی یا پیامک: 09395106248
تلگرام: @ma_limbs

چکیده

Messenger RNA (mRNA)-based vaccines are accelerating the discovery of new drugs and revolutionizing the pharmaceutical industry. However, selecting particular mRNA sequences for vaccines and therapeutics from extensive mRNA libraries is costly. Effective mRNA therapeutics require carefully designed sequences with optimized expression levels and stability. This paper proposes a novel contextual language model (LM)-based embedding method: mRNA2vec. In contrast to existing mRNA embedding approaches, our method is based on the self-supervised teacher-student learning framework of data2vec. We jointly use the 5' untranslated region (UTR) and coding sequence (CDS) region as the input sequences. We adapt our LM-based approach specifically to mRNA by 1) considering the importance of location on the mRNA sequence with probabilistic masking, 2) using Minimum Free Energy (MFE) prediction and Secondary Structure (SS) classification as additional pretext tasks. mRNA2vec demonstrates significant improvements in translation efficiency (TE) and expression level (EL) prediction tasks in UTR compared to SOTA methods such as UTR-LM. It also gives a competitive performance in mRNA stability and protein production level tasks in CDS such as CodonBERT.

چکیده به فارسی (ترجمه ماشینی)

واکسن های مبتنی بر مسنجر RNA (mRNA) در حال تسریع در کشف داروهای جدید و انقلابی در صنعت داروسازی هستند.با این حال ، انتخاب توالی mRNA خاص برای واکسن ها و روشهای درمانی از کتابخانه های گسترده mRNA پرهزینه است.درمان mRNA مؤثر نیاز به توالی با دقت طراحی شده با سطح بیان بهینه و ثبات دارد.این مقاله یک روش تعبیه مبتنی بر مدل زبان متنی جدید (LM) را ارائه می دهد: mRNA2VEC.برخلاف رویکردهای تعبیه کننده mRNA موجود ، روش ما مبتنی بر چارچوب یادگیری خود معلم و دانش آموز از DATA2VEC است.ما به طور مشترک از منطقه 5 'ترجمه نشده (UTR) و دنباله کدگذاری (CDS) به عنوان توالی ورودی استفاده می کنیم.ما رویکرد مبتنی بر LM خود را به طور خاص با mRNA با 1) با توجه به اهمیت موقعیت مکانی در توالی mRNA با نقاب احتمالی ، 2) با استفاده از حداقل پیش بینی انرژی آزاد (MFE) و طبقه بندی ساختار ثانویه (SS) به عنوان کارهای بهانه اضافی سازگار می کنیم.mRNA2VEC پیشرفتهای قابل توجهی در کارآیی ترجمه (TE) و سطح بیان (EL) در UTR در مقایسه با روش های SOTA مانند UTR-LM نشان می دهد.همچنین عملکرد رقابتی در ثبات mRNA و کارهای سطح تولید پروتئین در CDS مانند Codonbert ارائه می دهد.

📚 محتوای این محصول آموزشی (پکیج کامل)

علاوه بر مقاله اصلی انگلیسی که دریافت می کنید، برای یادگیری عمیق‌تر و تسلط کامل بر مباحث مجموعه‌ای از کتاب‌های آموزشی نیز ارائه می‌شود.

🎯 این بسته یک دورهٔ آموزشی کامل و چندلایه است؛ شامل ویدیوهای آموزشی، کتاب‌ها، تمرین‌ها و خودآزمایی.

ℹ️ نکات مهم هنگام خرید

  • این محصول به صورت فایل دانلودی کامل ارائه می‌شود.
  • توجه: لینک‌های اختصاصی دوره طی حداکثر 24 ساعت پس از ثبت سفارش ارسال می‌شوند.
  • دقت کنید لینک ها به شماره موبایل شما ارسال می شوند. پس در ارائه شماره موبایل صحیح دقت کنید.
  • برای راهنمایی در مورد نحوه دانلود به شماره 09395106248 پیامک دهید یا تماس بگیرید. (ایده آل ترین گزینه ارسال پیام در یکی از پیام رسان ها به همین شماره است تا سریعا لینک های محصول همان جا برای شما ارسال گردد.)
  • اگر پرداخت انجام شده ولی بعد از 24 ساعت هنوز لینک‌ها را دریافت نکرده‌اید، نام و نام خانوادگی و نام محصول را پیامک کنید تا لینک‌ها دوباره ارسال شوند.

💬 راه‌های ارتباطی پشتیبانی:
واتس‌اپ یا هر پیام رسان داخلی یا پیامک: 09395106248
تلگرام: @ma_limbs

نظرات

هنوز نظری ثبت نشده است.

وارد شوید تا نظر ثبت کنید.