ترجمه فارسی مقاله توالی یابی دقیق و مقرون به صرفه ژنوم کامل ویروس هپاتیت B با استفاده از نانوپور

انتخاب پلن

انتخاب پلن برای ادامه خرید الزامی است.

عنوان مقاله به انگلیسی Accurate and cost-efficient whole genome sequencing of hepatitis B virus using Nanopore
عنوان مقاله به فارسی توالی یابی دقیق و مقرون به صرفه ژنوم کامل ویروس هپاتیت B با استفاده از نانوپور
نویسندگان Joakim B. Stenbäck, Daniel Schmidt, Ulrika Noborg, Joel Gustafsson, Peter Norberg, Maria E. Andersson, Michael X Fu, Heli Harvala, Johan Ringlander
فرمت مقاله انگلیسی PDF
تعداد صفحات 16
لینک دانلود رایگان مقاله انگلیسی دانلود مقاله
دسته بندی موضوعات Infectious Diseases (except HIV/AIDS) بیماری های عفونی (به جز HIV/AIDS)

📚 محتوای این محصول آموزشی (پکیج کامل)

علاوه بر مقاله اصلی انگلیسی که دریافت می کنید، برای یادگیری عمیق‌تر و تسلط کامل بر مباحث مجموعه‌ای از کتاب‌های آموزشی نیز ارائه می‌شود.

🎯 این بسته یک دورهٔ آموزشی کامل و چندلایه است؛ شامل ویدیوهای آموزشی، کتاب‌ها، تمرین‌ها و خودآزمایی.

ℹ️ نکات مهم هنگام خرید

  • این محصول به صورت فایل دانلودی کامل ارائه می‌شود.
  • توجه: لینک‌های اختصاصی دوره طی حداکثر 24 ساعت پس از ثبت سفارش ارسال می‌شوند.
  • دقت کنید لینک ها به شماره موبایل شما ارسال می شوند. پس در ارائه شماره موبایل صحیح دقت کنید.
  • برای راهنمایی در مورد نحوه دانلود به شماره 09395106248 پیامک دهید یا تماس بگیرید. (ایده آل ترین گزینه ارسال پیام در یکی از پیام رسان ها به همین شماره است تا سریعا لینک های محصول همان جا برای شما ارسال گردد.)
  • اگر پرداخت انجام شده ولی بعد از 24 ساعت هنوز لینک‌ها را دریافت نکرده‌اید، نام و نام خانوادگی و نام محصول را پیامک کنید تا لینک‌ها دوباره ارسال شوند.

💬 راه‌های ارتباطی پشتیبانی:
واتس‌اپ یا هر پیام رسان داخلی یا پیامک: 09395106248
تلگرام: @ma_limbs

چکیده

Deep sequencing of the whole hepatitis B virus genome increases the analytical resolution and has the potential to improve molecular epidemiology investigations. The aim of this work was to develop and evaluate the performance of such deep sequencing using the Nanopore technology. The method includes an initial PCR step to generate two overlapping amplicons that cover the whole relaxed circular HBV genome found in circulating viral particles and covalently closed circular DNA in infected hepatocytes, followed by sequencing using the Nanopore rapid barcoding kit that allows parallel analysis of several samples in one reaction. The libraries can be sequenced with the standard Nanopore flow cell on MiniIon or GridIon devices, as well as the Flongle. The performance of the method was evaluated by comparing Nanopore and Sanger sequences or qPCR results from 64 clinical samples. The Nanopore-derived consensus sequences were, on average, 99.9% similar to those from Sanger sequencing and the full HBV genome was determined in samples with HBV DNA levels of approximately 3 log10 IU/mL with MagNA pure 96 extraction and < 2 log10 IU/mL using a high-volume manual extraction protocol on a subset of samples from patients with very low viral load (1.62-3.74 IU/mL). A perfect agreement with Sanger/qPCR-derived genotype was seen. The cost of sequencing per genome using the Nanopore method is low, ranging 6-37euros. We conclude that whole-genome sequencing of HBV with Nanopore is well suited for genomic characterization, antiviral resistance mutation analysis and genotyping of HBV in a routine laboratory setting.

چکیده به فارسی (ترجمه ماشینی)

توالی عمیق کل ژنوم ویروس هپاتیت B وضوح تحلیلی را افزایش می دهد و پتانسیل بهبود تحقیقات اپیدمیولوژی مولکولی را دارد.هدف از این کار توسعه و ارزیابی عملکرد چنین توالی عمیق با استفاده از فناوری نانوپور بود.این روش شامل یک مرحله PCR اولیه برای تولید دو آمپلیکون همپوشانی است که کل ژنوم HBV مدور آرام را که در ذرات ویروسی در گردش و DNA دایره ای بسته به صورت کووالانسی بسته در سلولهای کبدی آلوده موجود است ، پوشش می دهد ، و به دنبال آن توالی با استفاده از کیت بارکدهی سریع نانوپور امکان تجزیه و تحلیل موازی چند نمونه از نمونه ها را فراهم می کند.در یک واکنشکتابخانه ها را می توان با سلول جریان نانوپور استاندارد در دستگاه های Miniion یا Grion و همچنین Flongle ترتیب داد.عملکرد این روش با مقایسه توالی نانوپور و سانگر یا نتایج qPCR از 64 نمونه بالینی مورد بررسی قرار گرفت.توالی اجماع مشتق از نانوپور ، به طور متوسط ​​، 99.9 ٪ شبیه به توالی سانگر و ژنوم کامل HBV در نمونه هایی با سطح DNA HBV تقریباً 3 log10 IU/ml با استخراج Magna خالص 96 تعیین شد و <2 log10 IU/ML با استفاده از یک پروتکل استخراج دستی با حجم بالا بر روی زیر مجموعه ای از نمونه های بیماران با بار ویروسی بسیار کم (1.62-3.74 IU/ml).توافق کامل با ژنوتیپ مشتق از Sanger/qPCR مشاهده شد.هزینه توالی در هر ژنوم با استفاده از روش نانوپور کم است ، اعم از 6-37euros.نتیجه می گیریم که توالی ژنوم ژنوم HBV با نانوپور به خوبی برای خصوصیات ژنومی ، تجزیه و تحلیل جهش مقاومت ضد ویروسی و ژنوتیپ HBV در یک آزمایشگاه معمول مناسب است.

📚 محتوای این محصول آموزشی (پکیج کامل)

علاوه بر مقاله اصلی انگلیسی که دریافت می کنید، برای یادگیری عمیق‌تر و تسلط کامل بر مباحث مجموعه‌ای از کتاب‌های آموزشی نیز ارائه می‌شود.

🎯 این بسته یک دورهٔ آموزشی کامل و چندلایه است؛ شامل ویدیوهای آموزشی، کتاب‌ها، تمرین‌ها و خودآزمایی.

ℹ️ نکات مهم هنگام خرید

  • این محصول به صورت فایل دانلودی کامل ارائه می‌شود.
  • توجه: لینک‌های اختصاصی دوره طی حداکثر 24 ساعت پس از ثبت سفارش ارسال می‌شوند.
  • دقت کنید لینک ها به شماره موبایل شما ارسال می شوند. پس در ارائه شماره موبایل صحیح دقت کنید.
  • برای راهنمایی در مورد نحوه دانلود به شماره 09395106248 پیامک دهید یا تماس بگیرید. (ایده آل ترین گزینه ارسال پیام در یکی از پیام رسان ها به همین شماره است تا سریعا لینک های محصول همان جا برای شما ارسال گردد.)
  • اگر پرداخت انجام شده ولی بعد از 24 ساعت هنوز لینک‌ها را دریافت نکرده‌اید، نام و نام خانوادگی و نام محصول را پیامک کنید تا لینک‌ها دوباره ارسال شوند.

💬 راه‌های ارتباطی پشتیبانی:
واتس‌اپ یا هر پیام رسان داخلی یا پیامک: 09395106248
تلگرام: @ma_limbs

نظرات

هنوز نظری ثبت نشده است.

وارد شوید تا نظر ثبت کنید.