ترجمه فارسی مقاله بررسی فضای هایپرپارامتر مدلهای شبکه عصبی عمیق برای بهینهسازی مختصات واکنش: کاربرد در آلانین دیپپتید در آب
| عنوان مقاله به انگلیسی | Investigating the hyperparameter space of deep neural network models for reaction coordinate optimization: Application to alanine dipeptide in water |
| عنوان مقاله به فارسی | بررسی فضای هایپرپارامتر مدلهای شبکه عصبی عمیق برای بهینهسازی مختصات واکنش: کاربرد در آلانین دیپپتید در آب |
| نویسندگان | Kyohei Kawashima, Takumi Sato, Kei-ichi Okazaki, Kang Kim, Nobuyuki Matubayasi, Toshifumi Mori |
| فرمت مقاله انگلیسی | |
| تعداد صفحات | 19 |
| دسته بندی موضوعات | Chemical Physics,فیزیک شیمیایی , |
| توضیحات | Submitted 4 August, 2024; originally announced August 2024. , Comments: 10 pages, 10 figures, 2 table for main text, 9 pages for supplementary material |
| توضیحات به فارسی | ارسال شده در 4 اوت 2024 ؛در ابتدا اوت 2024 اعلام شد ، نظرات: 10 صفحه ، 10 شکل ، 2 جدول برای متن اصلی ، 9 صفحه برای مواد تکمیلی |
قیمت: 19,000 تومان
سفارش
با انتخاب این گزینه، علاوه بر دریافت مقاله اصلی، را نیز سفارش میدهید.
قیمت: 760,000 تومان
زمان تحویل: 2 تا 3 روز کاری
📚 محتوای این محصول آموزشی (پکیج کامل)
علاوه بر مقاله اصلی انگلیسی که دریافت می کنید، برای یادگیری عمیقتر و تسلط کامل بر مباحث مجموعهای از کتابهای آموزشی نیز ارائه میشود.
-
کتاب صدها نکته فارسی (خودمونی) – نسخه PDF — زبان ساده و کاربردی
مشاهده نمونه نسخه نکات ساده -
کتاب صدها نکته رسمی فارسی – نسخه PDF — نگارش استاندارد و علمی
مشاهده نمونه نسخه نکات رسمی -
کتاب صدها پرسش و پاسخ تشریحی – نسخه PDF
— هر سؤال همراه با پاسخ کامل برای درک عمیق مفاهیم
مشاهده نمونه نسخه پرسش و پاسخ -
کتاب پرسش و پاسخ چهارگزینهای – نسخه یادگیری سریع
— پاسخها بلافاصله بعد از سؤال برای مرور سریع
مشاهده نمونه نسخه کوییز سریع -
کتاب پرسش و پاسخ چهارگزینهای – نسخه خودآزمایی
— پاسخها در انتهای بخشها برای سنجش واقعی یادگیری
مشاهده نمونه نسخه آزمونی
🎯 این بسته یک دورهٔ آموزشی کامل و چندلایه است؛ شامل ویدیوهای آموزشی، کتابها، تمرینها و خودآزمایی.
ℹ️ نکات مهم هنگام خرید
- این محصول به صورت فایل دانلودی کامل ارائه میشود.
- توجه: لینکهای اختصاصی دوره طی حداکثر 24 ساعت پس از ثبت سفارش ارسال میشوند.
- دقت کنید لینک ها به شماره موبایل شما ارسال می شوند. پس در ارائه شماره موبایل صحیح دقت کنید.
- برای راهنمایی در مورد نحوه دانلود به شماره 09395106248 پیامک دهید یا تماس بگیرید. (ایده آل ترین گزینه ارسال پیام در یکی از پیام رسان ها به همین شماره است تا سریعا لینک های محصول همان جا برای شما ارسال گردد.)
- اگر پرداخت انجام شده ولی بعد از 24 ساعت هنوز لینکها را دریافت نکردهاید، نام و نام خانوادگی و نام محصول را پیامک کنید تا لینکها دوباره ارسال شوند.
💬 راههای ارتباطی پشتیبانی:
واتساپ یا هر پیام رسان داخلی یا پیامک:
09395106248
تلگرام: @ma_limbs
چکیده
Identifying reaction coordinates (RCs) from many collective variable candidates have been of great challenge in understanding reaction mechanisms in complex systems. Machine learning approaches, especially the deep neural network (DNN), have become a powerful tool and are actively applied. On the other hand, selecting the hyperparameters that define the DNN model structure remains to be a nontrivial and tedious task. Here we develop the hyperparameter tuning approach to determine the parameters in an automatic fashion from the trajectory data. The DNN models are constructed to obtain a RC from many collective variables that can adequately describe the changes of the committor from the reactant to product. The approach is applied to study the isomerization of alanine dipeptide in vacuum and in water. We find that multiple DNN models with similar accuracy can be obtained, indicating that hyperparameter space is multimodal. Nevertheless, despite the differences in the DNN model structure, the key features extracted using the explainable AI (XAI) tools show that all RC share the same character. In particular, the reaction in vacuum is characterized by the dihedral angles $φ$ and $θ$. The reaction in water also involves these dihedral angles as key features, and in addition, the electrostatic potential from the solvent to the hydrogen (H${}_{18}$) plays a role at about the transition state. The current study thus shows that, in contrast to the diversity in the DNN models, suitably optimized DNN models share the same features and share the common mechanism for the reaction of interest.
چکیده به فارسی (ترجمه ماشینی)
شناسایی مختصات واکنش (RC) از بسیاری از نامزدهای متغیر جمعی در درک مکانیسم های واکنش در سیستم های پیچیده از چالش بزرگی برخوردار بوده است.رویکردهای یادگیری ماشین ، به ویژه شبکه عصبی عمیق (DNN) به ابزاری قدرتمند تبدیل شده و به طور فعال کاربرد دارند.از طرف دیگر ، انتخاب HyperParameters که ساختار مدل DNN را تعریف می کنند ، همچنان یک کار غیرقانونی و خسته کننده است.در اینجا ما روش تنظیم HyperParameter را برای تعیین پارامترها به صورت خودکار از داده های مسیر توسعه می دهیم.مدل های DNN برای به دست آوردن RC از بسیاری از متغیرهای جمعی ساخته شده اند که می توانند به اندازه کافی تغییرات متعهد از واکنش دهنده به محصول را توصیف کنند.این روش برای مطالعه ایزومریزاسیون آلانین دیپپتید در خلاء و آب استفاده می شود.ما می دانیم که چندین مدل DNN با دقت مشابه می توان به دست آورد ، که نشان می دهد فضای هایپرپارامتر چندمودال است.با این وجود ، با وجود تفاوت در ساختار مدل DNN ، ویژگی های کلیدی استخراج شده با استفاده از ابزارهای قابل توضیح AI (XAI) نشان می دهد که همه RC یک شخصیت یکسان را دارند.به طور خاص ، واکنش در خلاء توسط زاویه های دیجیتال $ φ $ و $ θ $ مشخص می شود.واکنش در آب همچنین شامل این زوایای دیجیتال به عنوان ویژگی های کلیدی است ، و علاوه بر این ، پتانسیل الکترواستاتیک از حلال به هیدروژن (H $ {} _ {18} $) در مورد حالت انتقال نقش دارد.مطالعه حاضر نشان می دهد که ، بر خلاف تنوع در مدل های DNN ، مدل های DNN بهینه سازی شده بهینه شده ، ویژگی های یکسانی را به اشتراک می گذارند و مکانیسم مشترک را برای واکنش علاقه به اشتراک می گذارند.📚 محتوای این محصول آموزشی (پکیج کامل)
علاوه بر مقاله اصلی انگلیسی که دریافت می کنید، برای یادگیری عمیقتر و تسلط کامل بر مباحث مجموعهای از کتابهای آموزشی نیز ارائه میشود.
-
کتاب صدها نکته فارسی (خودمونی) – نسخه PDF — زبان ساده و کاربردی
مشاهده نمونه نسخه نکات ساده -
کتاب صدها نکته رسمی فارسی – نسخه PDF — نگارش استاندارد و علمی
مشاهده نمونه نسخه نکات رسمی -
کتاب صدها پرسش و پاسخ تشریحی – نسخه PDF
— هر سؤال همراه با پاسخ کامل برای درک عمیق مفاهیم
مشاهده نمونه نسخه پرسش و پاسخ -
کتاب پرسش و پاسخ چهارگزینهای – نسخه یادگیری سریع
— پاسخها بلافاصله بعد از سؤال برای مرور سریع
مشاهده نمونه نسخه کوییز سریع -
کتاب پرسش و پاسخ چهارگزینهای – نسخه خودآزمایی
— پاسخها در انتهای بخشها برای سنجش واقعی یادگیری
مشاهده نمونه نسخه آزمونی
🎯 این بسته یک دورهٔ آموزشی کامل و چندلایه است؛ شامل ویدیوهای آموزشی، کتابها، تمرینها و خودآزمایی.
ℹ️ نکات مهم هنگام خرید
- این محصول به صورت فایل دانلودی کامل ارائه میشود.
- توجه: لینکهای اختصاصی دوره طی حداکثر 24 ساعت پس از ثبت سفارش ارسال میشوند.
- دقت کنید لینک ها به شماره موبایل شما ارسال می شوند. پس در ارائه شماره موبایل صحیح دقت کنید.
- برای راهنمایی در مورد نحوه دانلود به شماره 09395106248 پیامک دهید یا تماس بگیرید. (ایده آل ترین گزینه ارسال پیام در یکی از پیام رسان ها به همین شماره است تا سریعا لینک های محصول همان جا برای شما ارسال گردد.)
- اگر پرداخت انجام شده ولی بعد از 24 ساعت هنوز لینکها را دریافت نکردهاید، نام و نام خانوادگی و نام محصول را پیامک کنید تا لینکها دوباره ارسال شوند.
💬 راههای ارتباطی پشتیبانی:
واتساپ یا هر پیام رسان داخلی یا پیامک:
09395106248
تلگرام: @ma_limbs
نظرات
هنوز نظری ثبت نشده است.
وارد شوید تا نظر ثبت کنید.