ترجمه فارسی مقاله اثرات آللی بر بیان KLHL17 احتمالاً با واسطه JunB/D زمینه ساز سیگنال PDAC GWAS در chr1p36.33 است.

چکیده

Pancreatic Ductal Adenocarcinoma (PDAC) is the third leading cause of cancer-related deaths in the U.S. Both rare and common germline variants contribute to PDAC risk. Here, we fine-map and functionally characterize a common PDAC risk signal at 1p36.33 (tagged by rs13303010) identified through a genome wide association study (GWAS). One of the fine-mapped SNPs, rs13303160 (r2=0.93 in 1000G EUR samples, OR=1.23, P value=2.74×10−9) demonstrated allele-preferential gene regulatory activity in vitro and allele-preferential binding of JunB and JunD in vitro and in vivo. Expression Quantitative Trait Locus (eQTL) analysis identified KLHL17 as a likely target gene underlying the signal. Proteomic analysis identified KLHL17 as a member of the Cullin-E3 ubiquitin ligase complex in PDAC-derived cells. In silico differential gene expression analysis of the GTExv8 pancreas data suggested an association between lower KLHL17 (risk associated) and pro-inflammatory pathways. We hypothesize that KLHL17 may mitigate inflammation by recruiting pro-inflammatory proteins for ubiquitination and degradation thereby influencing PDAC risk.

چکیده به فارسی (ترجمه ماشینی)

آدنوکارسینوما مجرای لوزالمعده (PDAC) سومین علت اصلی مرگ و میر ناشی از سرطان در ایالات متحده است که هر دو نوع ژرمن نادر و مشترک هم در خطر PDAC نقش دارند.در اینجا ، ما نقشه ریز و به صورت عملکردی یک سیگنال خطر PDAC مشترک را در 1P36.33 (برچسب RS13303010) مشخص می کنیم که از طریق یک مطالعه ارتباط گسترده ژنوم (GWAS) مشخص شده است.یکی از SNP های ریز و درشت ، RS13303160 (R2 = 0.93 در 1000G EUR نمونه ، OR = 1.23 ، مقدار P = 2.74 × 10-9) فعالیت تنظیم کننده ژن پیشفرنیایی آلل را در شرایط آزمایشگاهی و اتصال آلل از JUNB و JUND نشان داد.in vitro و in vivo.تجزیه و تحلیل مکان کمی صفت (EQTL) KLHL17 را به عنوان یک ژن هدف احتمالی زیر سیگنال شناسایی کرد.تجزیه و تحلیل پروتئومیک KLHL17 را به عنوان عضو مجتمع لیگاز ubiquitin Cullin-E3 در سلولهای مشتق از PDAC شناسایی کرد.در تجزیه و تحلیل بیان ژن دیفرانسیل سیلیکو از داده های لوزالمعده GTEXV8 ، ارتباط بین KLHL17 پایین تر (خطر مرتبط با خطر) و مسیرهای التهابی را نشان می دهد.ما فرض می کنیم که KLHL17 ممکن است با جذب پروتئین های التهابی برای همه گیر و تخریب در نتیجه بر خطر PDAC ، التهاب را کاهش دهد.